Понашање инклузије антрацена (мрав) у три циклодекстрина (бетациклодекстрин, хидроксипропил бетациклодекстрин иСулфобутилбетацицлодектрин) је истраживана симулацијом молекуларне динамике (МД). Резултати МД-а показали су да мрав може спонтано ући у шупљине ове три циклодекстрине. Разлика је у томе што када је паковање са сулбутилбетациклодекстрином, мрав може ући само у шупљину кроз широку ивицу сулбутилбетациклодекстрина. Затим су ефекти 2- хидроксипропил (ХП) и сулфонирани бутил (СБЕ) супституенте на структури циклодекстрина проучавани анализом структурног изобличења глукозних јединица сваког циклодекстрина.
Откривено је да су неутрални бетациклодекстрини показали коничну структуру, а присуство ХП-а или СБЕ група је увелико утицало на структуру. Секундарна предност због преливања јединице глукозе изазване флуктуацијом супституентске групе. Када је мрава укључена у шупљину, у току је у одређеној мери у одређеној мери која је у одређеној мјери која је у одређеној мјери била обновљена у коормацији шупљине три циклодекстрина. Истовремено, супституентна група се протеже дуж шупљине осе и комуницира са молекулом гостију.
Анализом интеракције између сваког циклодекстрина и мрава утврђено је да су замјенским групама прошириле јачину хидрофобне шупљине. И супституентне групе и јединице глукозе доприносе интеракцији са гостујућим молекулом. Конформацијске промене у циклодекстрини прстена доводе до смањене шупљине, што може омогућити да се чврсто веже на молекуле мрава.
